绩效工资的扣除通常遵循以下原则和步骤：
根据《工资支付暂行条例》第十五条，用人单位不得克扣劳动者工资，但在特定情况下可以代扣，例如个人所得税、社会保险费用、法院判决或裁定中要求的抚养费和赡养费等。
用人单位在扣除绩效工资时，必须有明确的工作要求和标准，并且不得随意扣除。
绩效工资作为工资的一部分，需要并入工资薪金所得进行个人所得税的代扣代缴。
具体的计税方法如下：
如果雇员当月工资薪金所得高于（或等于）税法规定的费用扣除额，则应纳税额 = 雇员当月取得全年一次性奖金 × 适用税率 - 速算扣除数。
如果雇员当月工资薪金所得低于税法规定的费用扣除额，则应纳税额 = （雇员当月取得全年一次性奖金 - 雇员当月工资薪金所得与费用扣除额的差额） × 适用税率 - 速算扣除数。
根据法律规定，每月扣除的绩效工资部分不得超过劳动者当月工资的20%。
如果劳动者违反用人单位的规章制度，用人单位可以适当扣除绩效工资，但每月扣除总额不得超过劳动者月工资的20%。
建议
用人单位在制定绩效工资扣除政策时，应明确扣除的标准和依据，确保合法合规。
劳动者应了解自己的工资构成和扣除规则，以便正确计算和缴纳税款。
双方应遵守相关法律法规，保障各自的合法权益。