药店纳税主要涉及以下几个方面：
药店销售非处方药品免征增值税，但对处方药、中成药、中药材等按13%的税率征收增值税。
零售药店一般纳税人增值税税率为13%，小规模纳税人增值税征收率为3%。
部分高档化妆品、烟草制品等需征收消费税。
药店需缴纳企业所得税，具体税率依据国家相关税法规定。
药店需缴纳城市维护建设税，税率根据地区不同分别为7%、5%或1%。
药店需缴纳教育费附加和地方教育附加，一般合计为增值税的7%。
药店需缴纳个人所得税，税率大约为2%左右。
药店可能还需缴纳一些其他税费，如工商管理费、价格调控基金等，具体金额和缴纳方式需根据当地政策确定。
纳税流程
药店在开业前必须向当地税务机关申请税务登记，取得税务登记证，并按照规定悬挂税务登记证。
药店在销售药品时必须开具正规发票，并建立健全的发票管理制度，确保发票的真实、完整、合法。
药店应按照国家税收法规的规定，建立健全的税务核算制度，确保纳税申报的准确性和及时性，包括销售额、税金、成本费用的核算。
药店应按月向国税和地税申报并缴纳相应的税款，可通过网上申报、银行转账等方式进行。
建议
药店应详细了解并遵守相关税收法规，确保合法合规经营。
建立健全的财务和税务管理制度，确保准确核算和及时申报税款。
根据自身经营规模和实际情况选择合适的纳税方式，如定期定额征收或查账征收。
及时咨询当地税务机关，获取最新的税收政策和申报指导。