昌吉公租房的申请流程如下：
申请人需要根据市、县级人民政府住房保障主管部门的规定，提交以下申请材料：
《昌吉市公租房申请表》及附带的个人信息申请书；
用人单位出具的收入证明和工作证明；
无房证明、房屋租赁证明或住房证明；
车管所出具的车辆查询信息；
身份证、户口簿复印件；
劳动管理部门已备案的劳动（聘用）合同复印件及缴纳社会保险费的证明；
婚姻状况证明；
其他应提交的材料。
申请人可以通过线上或线下两种方式进行申请：
线上办理：通过江西政务服务网、赣服通、赣通码“高效办成一件事”专区进行申请，具体操作指引可使用微信扫描相关二维码查阅。
线下办理：前往市政务服务大厅“公租房申请一件事”综合窗口进行申请。
市、县级人民政府住房保障主管部门在收到申请材料后，会会同有关部门进行审核：
对符合申请条件的申请人，应当予以公示，经公示无异议或者异议不成立的，登记为公共租赁住房轮候对象，并向社会公开；
对不符合申请条件的申请人，应当书面通知并说明理由。
申请人如对审核结果有异议，可以向市、县级人民政府住房保障主管部门申请复核：
市、县级人民政府住房保障主管部门应当会同有关部门进行复核，并在15个工作日内将复核结果书面告知申请人。
申请人成为公共租赁住房轮候对象后，等待住房保障主管部门的配租通知：
住房保障主管部门会根据申请人的轮候顺序和配租需求，进行公租房的分配。
建议：
申请人应提前准备好所有必要的申请材料，并确保材料的真实性和完整性。