公司社保减员的操作流程如下：
在员工离职后，企业需在社保系统内填写社保减员申请表。该表格应包括员工的个人信息、原参保地和所属险种等内容。
在办理减员手续之前，需先了解并确认该员工的缴费情况，检查是否有漏缴或多缴的社保费用，确保员工的社保权益不受损害。
填写完申请表后，需将表格及相关材料提交至当地社保部门进行审核。审核通过后，员工的社保账户将被从企业的社保账户中移除。
企业在办理减员手续的同时，需要整理和保留与员工离职和减员相关的资料，为今后的查证提供依据。
注意事项：
及时性：在员工离职后，企业应尽快办理社保减员手续，避免因延迟办理而产生的额外费用。
准确性：在填写申请表和提交材料时，应确保信息的准确性和完整性，以免因信息错误或遗漏而导致手续无法顺利办理。
避免误解：对于有误解的情况，例如认为员工的保险并未实际缴纳或认为员工未达到缴纳保险的资格等，企业应积极与员工沟通解释，并协助其办理相关手续。
所需材料：
营业执照
职工的身份信息
离职证明或单位印章
社会保险减员表
劳动合同（如需要）
办理渠道：
可以通过当地社会保险经办机构进行申请。
可以登录社会保险网上服务系统进行减员申报。
可以通过网上办税服务中心进行操作。
具体步骤：
1. 准备所需材料，包括社保减员表、职工的身份信息、离职证明或单位印章等。
2. 进入当地人社局官网或社会保险网上服务系统，填写相关电子表格并进行劳动用工备案。
3. 提交减员申请并等待社保部门审核。
4. 审核通过后，办理减员登记并核定社保费用。
5. 最后，将减员表及相关资料提交至当地社保部门，完成减员手续。
建议企业在办理社保减员时，提前准备好所有相关材料，并确保信息的准确性和完整性，以减少不必要的麻烦和延误。